经开区的建设发展主要经历了3个阶段，1992年4月，奎屯经济技术开发区成立，规划面积10.08平方公里。
2006年8月，奎屯—独山子石化工业园成立，规划面积89.9平方公里，包括奎屯市、独山子和第七师部分土地。
2010年7月，自治区将奎屯经济技术开发区与奎屯—独山子石化工业园合并，成立了奎屯—独山子经济技术开发区，规划面积93.38平方公里。
2011年4月成功升级为国家经开区后，设立奎东特色产业园，规划面积20平方公里，至此园区总面积达到113.38平方公里。目前分为4个区域，北一区53.38平方公里，南区20平方公里，北二区20平方公里，奎东特色产业园20平方公里。近年来，园区先后被评为国家工信部“新型工业化示范基地”、自治区“两化融合试验区”“循环经济示范区”、大型油气生产加工和储备基地、重要的棉纺、化纤及产业用纺织品生产基地，成功荣获“绿色工业园区”和“大宗固体废弃物综合利用示范基地”称号。
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